一般来说，男生生殖器长度的发育与雄激素水平有关，男生在12-14岁进入青春期以后，体内雄激素水平开始上升，会出现第二性征，如生殖器发育、面部长胡须、喉结隆起、嗓音低沉、形体发育等，生殖器长度才会逐渐增加。因此，12岁男生的生殖器可能刚开始发育或还未发育，其长度在4cm左右。
由于12岁男生刚开始进入青春期，生殖器官还有较大的发育空间，存在个体差异，不用过多担心，让其正常发育即可。如果进入青春期后生殖器仍呈儿童型，常温下短于3cm，即为小阴茎。通常是下丘脑垂体功能异常导致睾丸分泌的睾酮水平低下，影响生殖器正常发育导致的，还可伴随全身性发育迟缓、性功能异常、不育等。
若12岁男生的生殖器长度已经达到4.5cm以上，则可能是存在早熟的情况，建议家长及时带其前往小儿泌尿外科就诊，避免影响到男生之后的发育。由于男生青春期身体发育迅速，饮食中应添加营养丰富的食物，例如牛肉、鸡肉等，帮助满足身体需求。还可适当运动，例如跑步、打羽毛球等，有助于促进生长发育。同时应该注意个人外阴卫生，穿宽松的内裤，家长应注意其心理健康，可适当进行性教育。